アヌログナトゥスは翼長でもわずか45cmほどと、非常に小さい翼竜である。中生代でも最小級の翼竜であったようだ。

アヌログナトゥスはとても短い尻尾が目を引く。他の翼竜はだいたい尻尾が長めなので大きく異なる特徴だ。これによって俊敏で小回りがきく飛行を実現しているのだろう。

様々な事実がアヌログナトゥスは夜行性であったことを示している。現代の夜鷹やコウモリなどと同様に、大きな目を駆使して夜でも虫を狩っていたようだ。

この翼竜は主に虫を食べていた。横に広いカエルのような口を使って飛んでいる虫を捕食する食虫動物である。